目前本學院設置有機械與機電工程學系(含碩士班、博士班)、系統工程暨造船學系(含碩士班、博士班)、河海工程學系(含碩士班、碩專班與博士班)、海洋工程科技博士學位學程及海洋工程科技學士學位學程(馬祖分校)，並且設有“海洋能源科技學程”、“船舶機電學程”、“海洋工程建造科技學程”與“離岸風電學分學程”，使本院甚至其他學院學生可以依據社會需求，選擇適當學程以提昇畢業後就業品質。

　    本學院除培育一般綜合大學之工學人才之外，有關海洋工程之研究是本學院很重要之特色。與海洋有關之研究內容主要包含船舶設計與建造、海洋相關系統工程之整合、港灣工程與管理、海岸空間之開發與保護、船舶導航與通訊、海洋探測用具及儀器之設計、水下流體動力及噪音之研究、以及海洋防蝕材料之開發。 本學院除進行海洋科技相關領域之研究外，並積極參與國內工業、民生與國防所須之相關研究工作。諸如擴展通訊、噪音防制、水資源利用、防災以及水下噪音偵測等相關之研究，以期使本學院之發展能結合社會與國家需求。

整體發展及研究方向：

   一、教育目標：培育具備先進工程科技理論與實作能力，並兼具人文素養之人才。

   二、發展及研究方向：

1.           建構符合工程發展潮流之課程架構與學習環境
2.           培養學生跨領域整合之概念與知識
3.           推動重點科研、跨領域科技研究、產學合作能力與推廣服務
4.           推動國際學術交流與合作

                                                                                                                                                                                             更新日期：2024年6月3日